scoup: Simulate Codon Sequences with Darwinian Selection Incorporated as an Ornstein-Uhlenbeck Process
O artigo apresenta o scoup, um simulador de sequências de códons implementado em R e hospedado na plataforma Bioconductor, que integra conceitos de phylogenetics e population genetics ao fundir o modelo de mutação-seleção de Halpern-Bruno com um processo de Ornstein-Uhlenbeck para permitir a análise de paisagens de aptidão estáticas e dinâmicas sob seleção natural.